Habe genau das gleiche Problem.
Habe hier gesehen dass es zB mit Netzlaufwerken zusammenhängen kann die sich geändert haben: http://de.pdf24.org/faq/Probleme-bei-der-Installation-Die-anwendung-konnte-nicht-richtig-initialisiert-werden-%280xe06d7363%29.html
Ich habe auch die IP meines Netzlaufwerkes geändert, aber damit hatte PDF24 eigentlich nichts zu tun. Ich habe auch in der Registry nach pdf24 gesucht, ob das irgendwie die alte IP gespeichert hat oder so. Neuinstallation von pdf24 war auch nutzlos.